Я хочу выбрать строку файла, где абсолютное значение столбца 9 меньше 500. Столбец иногда положительный, иногда отрицательный.
awk -F'\t' '{ if ($9 < |500|) {print $0} }' > output.bam
Пока это не работает. Один раунд в Интернете сказал мне, что для использования абсолютного значения мы должны добавить
func abs(x) { return (x<0) ? x*-1 : x }
Тогда как мне поставить это вместе со значением столбца 9?? Я не знаю, что может быть правильным синтаксисом.
Для быстрых однострочников я использую такой подход:
awk -F'\t' 'sqrt($9*$9) < 500' > output.bam
Это быстро набирать, но я полагаю, что для больших заданий sqrt() приведет к снижению производительности.
{print} подразумевается, вы можете опустить эту часть.
- person Adrian Frühwirth; 13.11.2013
sqrt($9^2) (обратите внимание на использование ^ вместо ** для возведения в степень - ** не соответствует POSIX).
- person mklement0; 08.04.2014
Это слишком очевидно и/или не элегантно?
awk -F'\t' '$9 < 500 && $9 > -500' > output.bam
При использовании sqrt($9^2) происходит потеря точности. Это может быть проблемой, если вы хотите также напечатать абсолютное значение.
Решение: обработайте как текст и просто удалите начальный знак минус, если он есть.
Это гарантирует, что вывод точно соответствует вводу.
Код:
awk '{sub("^-", "", $9); if ($9 < 500) print $9}' inputfile
Вывод: чтобы получить абсолютное значение с помощью awk, просто удалите начальный знак минус (-) из поля, если он есть.
