Я хотел бы использовать пакет R, который не включен в установку по умолчанию размещенной версии Beaker, Beaker Lab. Код:
install.packages("raster")
терпит неудачу с сообщением:
Error
Installing package into '/usr/local/lib/R/site-library'
Есть ли способ установить новые библиотеки в Beaker Lab?
Чтобы установить пакеты R:
1) Откройте рабочее пространство, нажмите BROWSE и создайте каталог rpackages.
2) Создайте пустой блокнот R
3) Тип:
install.packages(‘packagename’, ‘/mnt/scratch/rpackages’, repos=’http://cran.us.r-project.org’)
и запустить ячейку
4) Дождаться окончания установки
5) Если установка зависает на какое-то время, значит что-то не так -> перезагрузите браузер, закройте блокнот, снова откройте блокнот и повторите команду установки. Это продолжится с того места, где оно было до блокировки.
Чтобы использовать установленные пакеты:
В блокноте R в первой ячейке (или ячейке перед использованием пакета) введите:
.libPaths(c(‘/mnt/scratch/rpackages’,.libPaths()))
И запустить ячейку
Вот пример в Beaker Lab
https://lab.beakernotebook.com/approval/view/8645c600-3ec4-11e6-b811-8b63dac7dd4c
