На днях я просматривал список бесплатных курсов Udemy и нашел предлагаемый курс по биоинформатике. Так как это было менее двух часов и бесплатно, единственное, что я должен был потерять, это два часа моего времени. Поэтому я приступил к изучению биоинформатики, поскольку она связана с машинным обучением.

Курс был разбит на два раздела, первый из которых представляет собой теоретическое обсуждение различных библиотек, которые можно использовать с языком программирования Python, а второй раздел представляет собой три мини-проекта:

Секция 1

Раздел 1 является введением. В нем обсуждается, что такое биоинформатика, а также общие темы python и sklearn, характерные для этого жанра. Специальная библиотека для этого курса — biopython.

Раздел 2

Раздел 2 курса состоит из трех проектов, которые студент должен выполнить.

Проект 1 и проект 2 состоят из базовой последовательности Python. Автор курса явно много знает о биоинформатике, поэтому смог написать код на чистом Python.

Проект 2 представляет собой анализ последовательности с участием Biopython. Предполагается, что Biopython проще в использовании, чем другие библиотеки Python, но мне не удалось найти функции, которые идут с этой библиотекой.

Я чувствую, что человек должен хорошо разбираться в биоинформатике, чтобы успешно завершить проект 1 и проект 2.

Проект 3 — это пример биоинформатики с использованием набора данных в Kaggle. Я сделал прогнозы по набору данных, и ссылку на пост, который я написал, можно найти здесь: https://tracyrenee61.medium.com/how-i-used-gridsearchcv-to-score-100-accuracy-on-a -биоинформатика-набор данных-f87ac48f4b56?sk=8f4298daa8b6e4047329d0023184ed74»

В заключение, я рад, что прошел курс, но я не узнал о биоинформатике столько, сколько хотел бы. Человек должен знать о биоинформатике, прежде чем он сможет кодировать с нуля или использовать библиотеку biopython. Мне не удалось найти много документации по biopython, поэтому мне было сложно его использовать. Поскольку библиотека sklearn настолько информативна, я просто остановился на этой библиотеке, в которой у меня больше всего компетенций.