r: package arm: ошибка при загрузке: обнаружены функции при экспорте методов из пространства имен «arm», которые не являются общими для S4: «fixef», «ranef»

> library(arm)
Loading required package: lme4
Loading required package: RcppEigen
Loading required package: R2WinBUGS
Loading required package: foreign
Error : Functions found when exporting methods from the namespace ‘arm’ which are not S4 generic: ‘fixef’, ‘ranef’
Error: package/namespace load failed for ‘arm’

может быть актуально: версия R 2.15.3. арм версия 1.6-05. Версия lme4 — 0.99999911-1. Я запускал update.packages() перед публикацией.

В настоящее время мне интересно, несовместимы ли последние версии arm и lme4. Я хочу использовать функцию predict.mermod() в новом lme4, но я также полагаюсь на руку при использовании lme4. Я попытался загрузить руку с отсоединенным lme4, но lme4 является обязательным пакетом для руки, так что это тоже не сработало. Спасибо за помощь!


r arm lme4
person Mariana    schedule 21.04.2013    source источник
comment
Должно ли это быть направлено сопровождающему arm?   -  person IRTFM    schedule 21.04.2013
comment
Что бы это ни стоило, install.packages('arm'); library(arm) работает под R-3.0.0. возможно update.packages() получит работающую установку?   -  person Martin Morgan    schedule 21.04.2013
comment
Я вижу, что текущая версия 1.6-05. Так что, возможно, спецификации версии в пакете неверны (или update.packages не был запущен с checkBuilt=TRUE), или Мариана пытается загрузить пакет, скомпилированный для r3.0.0, в R 2.15.3?   -  person IRTFM    schedule 21.04.2013
comment
Спасибо за помощь! Я запустил update.packages(checkBuilt=TRUE), но, кроме того, я обновил lme4 новой версией r-forge, чтобы получить прогнозирование.mermod(). Я не верю, что запускаю пакеты R3.0 в 2.15.3. lme4 грузится без ошибок и arm не жалуется на версию R.   -  person Mariana    schedule 21.04.2013
comment
Я использую 2.15.3 и новую установку arm, и все работает отлично.   -  person Roman Luštrik    schedule 21.04.2013
comment
Подсказка: как насчет sessionInfo()/, начиная с чистого сеанса R, возможно, с --vanilla? В частности, было ли у вас загружено nlme до того, как вы попробовали это? (Хотя я не могу реплицировать даже при первой загрузке nlme...)   -  person Ben Bolker    schedule 21.04.2013

Ответы (1)


arrow_upward
1
arrow_downward

Текущая версия arm несовместима с разрабатываемой версией lme4 из R-forge/GitHub. Я предполагаю, что arm все еще ожидает, что lme4 создаст mer классов вместо новых merMod.

(Примечание: последняя версия car от R-forge (2.0-19) поддерживает классы merMod, например, для Anova(), я узнал сегодня (на случай, если вам это понадобится))

person ROLO    schedule 16.07.2013
comment
См. также http://htmlpreview.github.io/?https://github.com/lme4/lme4/blob/master/misc/pkgtests/lme4_compat_report.html -- я полагаю, что у нескольких сопровождающих пакетов есть частные исправленные версии, которые они планируют выпустить, когда будет выпущена lme4-стабильная версия. . - person Ben Bolker; 16.07.2013