Сохранение в формате 16-битного .raww (формат необработанного изображения (Word)) в ImageJ или MATLAB для импорта в DaVis

У меня есть набор 32-битных файлов TIFF, которые образуют объемный набор данных (т. е. стек). Используя ImageJ, я уменьшаю их дискретизацию до 16-бит и экспортирую в виде необработанного файла. Предполагается, что затем они будут импортированы в систему LaVision DaVis для выполнения корреляции цифровых объемов.

Проблема в том, что DaVis может правильно импортировать 16-битные необработанные файлы только в том случае, если они имеют формат, который программное обеспечение описывает как «.RAWW (формат необработанного изображения (Word)»). Для 8-битных данных другими вариантами импорта являются .RAF (Raw float) или .RAW (RAw byte), но ни один из этих форматов не работает с 16-битными данными, так как изображение искажается при импорте в DaVis. Я не нашел способа управлять необработанной настройкой SaveAs в ImageJ, а также ссылок на ImageJ или MATLAB, поддерживающих сохранение в формате .RAWW, а также каких-либо ссылок на формат .RAWW в Интернете.

Может ли кто-нибудь предложить, как я могу экспортировать .RAWW или конвертировать .RAW в .RAWW? Если нет, может ли кто-нибудь предоставить мне какую-либо информацию о формате .RAWW?

Предпочтительны решения в ImageJ или MATLAB, но все будет полезно.

Заранее спасибо за вашу помощь!


person Jordini    schedule 05.09.2013    source источник
comment
Вы обращались за поддержкой к LaVision? Они должны быть в состоянии сказать вам, как правильно импортировать 16-битные данные.   -  person Jan Eglinger    schedule 09.09.2013


Ответы (1)


В своем документе LaVision говорит:

  • Supply non-segmented images. We need the raw images with the full contrast info
    • Little endian (intel) byte order
  • Please supply images as RAW volume images.
    • If you have TIF stacks, please use ImageJ to convert to RAW volume images before sending
  • Please ensure volume RAW image file has appropriate extension
    • .RAW (byte) : 8bit unsigned
    • .RAWW (слово): 16 бит без знака
    • *.RAF (с плавающей запятой): 32-битное реальное

Насколько я понимаю, вы сохраняете свой стек как изображение RAW с выбранной вами глубиной и переименовываете файлы в соответствии с вашим выбором.

Твердый ответ тоже помог бы мне.

person loukote    schedule 30.01.2014