Использование модуля GZIP с Python

Если вы не получили сообщения об ошибке, вероятно, модуль gzip выполняется правильно, и файл уже распаковывается.

Точное определение «распакованного» зависит от контекста:

Я не хочу читать файлы, только распаковать их

Модуль gzip не работает как настольная программа архивации, как 7-zip — вы не можете «распаковать» файл, не «прочитав» его. Обратите внимание, что «чтение» (в программировании) обычно означает просто «сохранение (временное) в оперативной памяти компьютера», а не «открытие файла в графическом интерфейсе».

То, что вы вероятно подразумеваете под "распаковкой" (как в настольной программе архивирования), более точно описывается (в программировании) как "чтение потока/буфера в памяти из сжатого файла и записать его в новый файл (и, возможно, впоследствии удалить сжатый файл)"

inF = gzip.open(file, 'rb')
s = inF.read()
inF.close()

С этими строками вы просто читаете поток. Если вы ожидаете, что будет создан новый «несжатый» файл, вам просто нужно записать буфер в новый файл:

with open(out_filename, 'wb') as out_file:
    out_file.write(s)

Если вы имеете дело с очень большими файлами (больше, чем объем вашей оперативной памяти), вам придется применить другой подход. Но это тема для другого вопроса.

Вы должны использовать with для открытия файлов и, конечно же, для сохранения результата чтения сжатого файла. См. gzip документацию:

import gzip
import glob
import os
import os.path

for gzip_path in glob.glob("%s/*.gz" % PATH_TO_FILE):
    if not os.path.isdir(gzip_path):
        with gzip.open(gzip_path, 'rb') as in_file:
            s = in_file.read()

        # Now store the uncompressed data
        path_to_store = gzip_fname[:-3]  # remove the '.gz' from the filename

        # store uncompressed file data from 's' variable
        with open(path_to_store, 'w') as f:
            f.write(s)

В зависимости от того, что именно вы хотите сделать, вы можете взглянуть на tarfile и его параметр 'r:gz' для открытия файлов.

Вы распаковываете файл в переменную s и ничего с ним не делаете. Вы должны прекратить искать stackoverflow и прочитать хотя бы учебник по python. Серьезно.

Во всяком случае, с вашим кодом что-то не так:

1. вам нужно СОХРАНИТЬ разархивированные данные в s в какой-то файл.

2. нет необходимости копировать настоящие *.gz файлы. Потому что в вашем коде вы распаковываете исходный файл gzip, а не копию.

3. вы используете file, зарезервированное слово, в качестве переменной. Это не ошибка, просто очень плохая практика.

Вероятно, это должно делать то, что вы хотели:

import gzip
import glob
import os
import os.path

for gzip_path in glob.glob(PATH_TO_FILE + "/*.gz"):
    if os.path.isdir(gzip_path) == False:
        inF = gzip.open(gzip_path, 'rb')
        # uncompress the gzip_path INTO THE 's' variable
        s = inF.read()
        inF.close()

        # get gzip filename (without directories)
        gzip_fname = os.path.basename(gzip_path)
        # get original filename (remove 3 characters from the end: ".gz")
        fname = gzip_fname[:-3]
        uncompressed_path = os.path.join(FILE_DIR, fname)

        # store uncompressed file data from 's' variable
        open(uncompressed_path, 'w').write(s)

Я смог решить эту проблему с помощью модуля подпроцесса:

for file in glob.glob(PATH_TO_FILE + "/*.gz"):
    if os.path.isdir(file) == False:
        shutil.copy(file, FILE_DIR)
        # uncompress the file
        subprocess.call(["gunzip", FILE_DIR + "/" + os.path.basename(file)])

Поскольку моей целью было просто распаковать архив, приведенный выше код выполняет это. Архивные файлы размещаются в центральном месте, копируются в рабочую область, распаковываются и используются в тестовом примере. модуль GZIP был слишком сложен для того, что я пытался сделать.

Спасибо всем за помощь. Это очень ценится!

Я думаю, что есть гораздо более простое решение, чем другие представленные, учитывая, что оператор хотел только извлечь все файлы в каталоге:

import glob
from setuptools import archive_util

for fn in glob.glob('*.gz'):
  archive_util.unpack_archive(fn, '.')