OpenCPU и многостраничные графики

Я пытаюсь захватить мультиграфический PDF-файл из функции. В R это дает мне трехстраничный PDF:

pdf(file='test.pdf', onefile=TRUE)
lapply(1:3, 'plot')
dev.off()

Использование OpenCPU:

$ curl http://localhost:6977/ocpu/library/base/R/lapply -H 'Content-Type: application/json' -d '{"X":[1,2,3], "FUN":"plot"}'
/ocpu/tmp/x0dc3dad0/R/.val
/ocpu/tmp/x0dc3dad0/graphics/1
/ocpu/tmp/x0dc3dad0/graphics/2
/ocpu/tmp/x0dc3dad0/graphics/3
/ocpu/tmp/x0dc3dad0/stdout
/ocpu/tmp/x0dc3dad0/source
/ocpu/tmp/x0dc3dad0/console
/ocpu/tmp/x0dc3dad0/info

Я могу получить любую из отдельных страниц в виде одностраничного PDF-файла, но не в виде одного комбинированного файла.

Два возможных обходных пути, не без проблем:

  1. Используйте par(mfrow), layout() или аналогичный механизм, хотя в конце концов это создаст изображение монстра (в моем коде я имею дело с более чем тремя изображениями).

  2. Используйте tempfile, создайте файл Rmd на лету, верните имя файла в сеансе (еще не тестировали это) и используйте обработку файлов Rmd в OpenCPU. К сожалению, теперь это использует геометрию LaTeX и нумерацию страниц (для этого существуют обходные пути).

Есть ли другие способы сделать это?


r pdf opencpu
person r2evans    schedule 02.04.2014    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
1
arrow_downward

Хороший вопрос. OpenCPU захватывает графику, используя evaluate, которая сохраняет каждую графику отдельно. Сам API не поддерживает объединение нескольких изображений в одном файле. Лично я бы выполнил такую ​​PDF постобработку на уровне приложения (т. е. с помощью инструментов, отличных от R), но, возможно, было бы полезно поддерживать это в API.

Некоторые предложения:

  • Любой файл, который ваша функция/скрипт R сохраняет в рабочий каталог (например, getwd()), также станет доступен через API. Итак, одна вещь, которую вы можете сделать, это вручную создать в своем коде R объединенный файл pdf и сохранить его в рабочем каталоге, а затем загрузить его через opencpu.

  • Графика на самом деле является recordedPlot объектами, и помимо png, pdf и svg вы также можете получить графику как rds или rda. Таким образом, вы можете написать функцию R, которая загружает объект recordedPlot из API, а затем распечатывает его. Не уверен, что это будет полезно в вашем случае использования.

person Jeroen    schedule 02.04.2014
comment
Это то, что я подозревал, и, поскольку я не владею recordedPlot, я хотел убедиться. Я также подозревал, что дело в рабочем каталоге, поэтому я думаю, что tempfile() и Rmd могут иногда работать. Это также объясняет, почему графики, которые хорошо отображаются (т. е. рассчитываются интервалы между текстом/элементами) при тестировании, не всегда также хорошо отображаются с помощью этого механизма. (Постобработка нескольких PDF-файлов с помощью инструментов, отличных от R, будет зависеть от наличия соответствующих инструментов на клиентском компьютере, а не от того, на что я могу положиться.) Спасибо. - person r2evans; 03.04.2014