Я пытаюсь установить пакет Bioperl в среде Perl версии 5.20.0, но не могу получить доступ к материалам. Идея и предложение веб-сайтов различаются, и это будет непросто для меня. Пожалуйста, предложите мне протоколы для установки Bioperl в Ubuntu 12.04LS.
Установка bioperl в Ubuntu 12.04LS
comment
askubuntu.com или, возможно, bit.ly/U6xsGL.
- person mpapec schedule 02.06.2014
Ответы (1)
Источник: http://www.bioperl.org/wiki/Installing_BioPerl_on_Ubuntu_Server
Установите и настройте базовый сервер Ubuntu
Установите, затем настройте.
apt-get clean
apt-get update
apt-get upgrade
apt-get install ssh screen
apt-get clean
Установите как можно больше с помощью apt-get
Включите Universe и Multiverse в /etc/apt/sources.list
apt-get update
apt-get install \
lynx unzip zip ncftp gcc libc6-dev make mysql-server apache2 \
perl libgd-gd2-perl libcgi-session-perl libclass-base-perl libexpat1-dev
apt-get clean
Установите модули CPAN и perl, недоступные через apt-get
cpan -i 'Text::Shellwords' # choose defaults if first time
Установить Биоперл
cd /tmp
wget -N http://bioperl.org/DIST/current_core_unstable.tar.bz2
tar -xjvf current_core_unstable.tar.bz2
cd bioperl-*
perl Build.PL # choose the defaults
./Build test
./Build install
person
Chankey Pathak
schedule
02.06.2014
Да .. Я выполнял эту процедуру ранее .. но bioperl не был установлен, и его пакет не был включен.
- person Rajkishore90; 02.06.2014
Вы столкнулись с какой-либо ошибкой при выполнении вышеизложенного или все прошло нормально?
- person Chankey Pathak; 02.06.2014
Это не рекомендуется делать, поскольку версии bioperl, которую вы устанавливаете выше, уже более 7 лет. Это приведет к множеству проблем, которые были исправлены. Рекомендуется установить последнюю стабильную версию с CPAN или последнюю версию разработки с Github.
- person SES; 02.06.2014
Спасибо всем .. !! Если у вас есть ошибка ... это с моей ОС Ubuntu. Bioperl успешно установлен.
- person Rajkishore90; 02.06.2014
