По умолчанию средство проверки орфографии vim учитывает код, поэтому оно не проверяет кодовые части файла. По сути, в уценке он считает (многострочные таблицы pandoc) кодами и, таким образом, не проверяет их содержимое на правописание.
Можно ли переопределить это? Или включите проверку орфографии для всего файла, включая код.