Проблема, с которой я столкнулся, заключалась в определении имени процесса/имени библиотеки в скрипте. Во время кросс-компиляции имя процесса и имя библиотеки ссылаются на реальный путь процесса/библиотеки на хосте (что я понял после просмотра сгенерированного файла . ко).
Поскольку реальный путь к хосту и цели отличается, инструментарий кросс-компиляции не работает.