Маллет: Алфавиты не совпадают, исключение при повторном создании модели в одной программе

Я изучил маллет, и он работает хорошо. То, что я пытаюсь сделать, это дважды создать модель в области программы и столкнуться с исключением. Мой программный код выглядит так:

List<String> commands = new ArrayList<String>();
commands.add("--input input.mallet --output-classifier output_classifier.classifier --trainer MaxEnt --report train:accuracy");

commands.add("--input input.mallet --output-classifier output_classifier.classifier --trainer MaxEnt --report train:accuracy");

for( int index = 0; index < commands.size(); index++ ) {
    try {
        Vectors2Classify.main(commands.get(index).split(" "));
    } catch (EvalError e) {
        // TODO Auto-generated catch block
        e.printStackTrace();
    } catch (IOException e) {
        // TODO Auto-generated catch block
        e.printStackTrace();
    }
}

Первая команда выполняется успешно. По второй команде я получаю следующее исключение.

Exception in thread "main" java.lang.IllegalArgumentException: Alphabets don't match: Instance: [9327, 3], InstanceList: [9327, 3]

    at cc.mallet.types.InstanceList.add(InstanceList.java:335)
    at cc.mallet.types.InstanceList.shallowClone(InstanceList.java:213)
    at cc.mallet.types.InstanceList.split(InstanceList.java:513)
    at cc.mallet.classify.tui.Vectors2Classify.main(Vectors2Classify.java:397)

Я искал эту проблему, но не нашел решения до сих пор. Похоже, до сих пор никто не пытался сделать модель дважды в рамках программы.
Если кто-то может помочь мне в этом, буду благодарен вам.