Особый цвет ячеек с помощью Kable в Rmarkdown

Вы можете использовать функцию cell_spec () в библиотеке kableExtra, а также mutate () в пакете Dplyr.

Это выглядело бы примерно так:

table <- df %>%  
  mutate(Column = cell_spec(Column, "html", background_as_tile = T, background = factor(Column, colours))) %>%
  kable()...