Как сделать паузу в цикле java for на 1/2 секунды между каждой итерацией?

Если код, выполняемый симуляцией, быстрый и не потребляет слишком много ресурсов ЦП и времени, рассмотрите возможность использования таймера Swing для создания циклов и задержки. В противном случае вам нужно будет использовать фоновый поток, например, с объектом SwingWorker.

Например, при использовании Swing Timer и SwingWorker:

   private class MultipleGensListener implements ActionListener {
      protected static final int MAX_INDEX = 25;

      public void actionPerformed(ActionEvent e) {
         int timerDelay = 500; // ms delay
         new Timer(timerDelay, new ActionListener() {
            int index = 0;

            public void actionPerformed(ActionEvent e) {
               if (index < MAX_INDEX) { // loop only MAX_INDEX times
                  index++;

                  // create the SwingWorker and execute it
                  new SwingWorker<Void, Void>() {
                     @Override
                     protected Void doInBackground() throws Exception {
                        game.runSimulationOneGen(); // this is done in background thread.
                        return null;
                     }

                     @Override
                     protected void done() {
                        changeGrid(); // this is called on EDT after background thread done.
                     }
                  }.execute(); // execute the SwingWorker
               } else {
                  ((Timer) e.getSource()).stop(); // stop the timer
               }
            }
         }).start(); // start the Swing timer
      }
   }

НИКОГДА НЕ БЛОКИРУЙТЕ ПОТОК СОБЫТИЙ GUI

вы можете использовать для этого таймер, и он сработает только 25 раз

final Timer t = new Timer(500,null);
t.addActionListener(new ActionListener(){
     int i=0;
     public void actionPerformed(ActionEvent e){
         game.runSimulationOneGen();//run 1 iteration per tick
         changeGrid();
         if(i>25){t.stop();}
         i++;
     }
});
t.setRepeats(true);
t.start();

Кстати, причина, по которой показана только последняя итерация, заключается в том, что обновления графического интерфейса (перерисовки) выполняются в отдельном событии, но чтобы запустить другое событие, вам нужно вернуться из метода прослушивателя, который вы не сделали

Таймер, который я показал, представляет собой более сложную итерацию, которая позволяет запускать другие события между итерациями, позволяя графическому интерфейсу отображать изменения.

проверьте мой пост, в котором показаны оба метода java.swing.Timer #setDelay(int)

и

правильное использование Thread.sleep (целое число)

проблема с отображением курсора ожидания Java