Как восстановить CRLF в репозитории GIT, чтобы избежать конфликтов слияния

Я создал свой репозиторий с помощью autocrlf=true, а затем сделал несколько проверок и коммитов с помощью autocrlf=false. Затем переключился обратно на autocrlf=true (ОС Win). Все вроде бы было ок, пока я не начал слияние между ветками. Возникало много конфликтов слияния, когда весь файл помечался как измененный из-за измененного eols (я полагаю, это были те файлы, которые были извлечены и зафиксированы с autocrlf=false).

Есть некоторая история, которая для меня стоит, поэтому я предпочитаю сделать некоторое преобразование или исправить коммиты с преобразованным eols, а не создавать новое репо и начинать новую жизнь.

Вот как я понимаю autocrlf (ОС Win):

случай если autocrlf=true

WorkingTree ->  commit  -> GITRepository
CRLF         CRLF to LF      LF
LF           no conv.        LF
WorkingTree <- checkout <- GITRepository
CRLF         LF to CRLF      LF

случай если autocrlf=false

WorkingTree ->  commit  -> GITRepository
CRLF         no conv.      CRLF
LF           no conv.      LF
WorkingTree <- checkout <- GITRepository
CRLF         no conv.      CRLF
LF           no conv.      LF

Теперь я хотел бы использовать GIT с autocrlf=false, поэтому я решил проверить каждую ветку, восстановить eols исходных файлов с помощью утилиты Конвертер EOL и зафиксируйте его с помощью CRLF. Я это сделал, но по прошествии времени остались некоторые файлы, которые, вероятно, не были проверены после того, как я изменил настройку autocrlf на false (или эти файлы объединились из старых неисправленных коммитов? При конвертации я использовал маску *.filetype для автоматизировать обработку всех LF в CRLF, поэтому для меня нет другого объяснения такой ситуации). Я также пытался touch файлы, чтобы повторно зафиксировать их все (как я видел где-то здесь в stackoverflow), но изменение даты не имеет отношения к GIT AFAIK. Я также читал Как устранить ущерб, нанесенный autocrlf, но не уверен, что это мой случай, а также не понимаю фокусов волшебника.

Как я могу избавиться от этого беспорядка, пожалуйста?