Я ищу способ разделить свои данные на группы, где каждая группа состоит из того же размера окна, который я определяю. Chrom Start End chr1 1 10 chr1 11 20 chr1 21 30...

У меня есть следующий объект GenomicRanges , созданный с помощью этого: library(GenomicRanges) gr <- GRanges(seqnames = "chr1", strand = c("+", "-","-", "+"),ranges = IRanges(start = c(1,3,3,5), width = 3)) gr Это выглядит так:...

У меня есть 2 набора попарных выравниваний, где геном запроса 1 (q1) выровнен с эталонным геномом, а геном запроса 2 (q2) выровнен с тем же эталонным геномом. Поэтому у меня есть оба выравнивания с системой координат в эталонном геноме. Выравнивания...

У меня есть 2 геномных диапазона g1<-GRanges(c("chr1:0-14","chr1:15-29"), score=c(20.2,10.4));g1 GRanges object with 2 ranges and 1 metadata column: seqnames ranges strand | score <Rle> <IRanges>...