Вопросы по теме 'igraph'
Создание списка смежности из data.frame
У меня есть data.frame с двумя столбцами: узел A, узел B. Каждая запись в кадре подразумевает край в графе между узлами A и B.
Для преобразования этого data.frame в список смежности должен быть хороший однострочный файл. Какие-нибудь намеки?
5323 просмотров
schedule
29.12.2022
сделать цикл для создания списка объектов igraph в R
Я хотел бы создать список объектов Igraph с данными, используемыми для каждого объекта Igraph, определяемого другой переменной.
Вот как я создаю один объект Igraph
netEdges <- NULL
for (idi in c("nom1", "nom2", "nom3")) {
netEdge...
1378 просмотров
schedule
10.04.2023
Как рассчитать стоимость графа mst.
Я работаю на C, используя библиотеку igraph. Мне нужно получить минимальное остовное дерево для данного графа, хранящегося в типе igraph_graph_t (g). Также у меня есть igraph_vector, содержащий вес каждого ребра (w). Ниже мой звонок:...
544 просмотров
schedule
10.12.2022
Импорт большого объема памяти iGraph исчерпан
Я пытаюсь импортировать большой файл LGL (~ 2 ГБ), и я пытаюсь импортировать его в igraph, используя
graph = Graph.Read_Lgl("Biggraph.lgl")
Ошибка, которую он выдает,
Traceback (most recent call last):
File "graph.py", line8, in...
401 просмотров
schedule
30.01.2024
оси igraph xlim ylim строятся неправильно
если я сделаю график g :
g <- read.table(text="
A B W
1 55 3
2 55 5
3 99 6 ",header=TRUE)
library(igraph)
g <- graph.data.frame(g)
и матрица координат:
y<-1:5
x<-c(0.1,0.1,0.2,0.2,0.8)
l<-data.frame(x,y)...
9008 просмотров
schedule
30.05.2022
Круговые циклы в пакете R iGraph
Как с помощью iGraph представить саморефлексивные узлы с помощью кривых в форме круга? По умолчанию эти кривые представлены в виде защемленной или каплевидной петли.
2015 просмотров
schedule
07.05.2023
Расчет связности блоков igraph 0.5.4
Есть ли более или менее прямой способ оценить связность для каждого связанного блока (то есть результат cohesive.blocks() ) в igraph 0.5.4?
В актуальной версии (0.6) есть функция cohesion() , а в версии 0.5.x ее нет. Есть ли более простой способ...
368 просмотров
schedule
19.07.2023
Клики для ориентированных графов в igraph
Я работаю над сетью Twitter, основанной на отношениях подписчиков в R. В этой сети я хочу определить размер самых больших клик внутри каждого, кто может читать твиты друг друга на своей временной шкале. Поэтому мне понадобятся самые большие .клики....
3162 просмотров
schedule
01.08.2022
графически отображать невзаимные ребра после преобразования в неориентированный граф с помощью взаимного
Я работаю над ориентированным графом в igraph для R. Я пытаюсь преобразовать его в неориентированный граф, в котором сохраняются только обратные ребра первого. Должно быть легко, но я получаю странные результаты.
сначала я сделал это так...
986 просмотров
schedule
03.08.2022
Добавьте текстовое свойство к узлам в igraph с помощью R
У меня возникла проблема при добавлении свойств узлов в igraph, работающем с R. Я создал текстовый список с именем journal.txt и хочу присвоить узлам моего графика свойство. С другими текстовыми или числовыми списками у меня не было абсолютно никаких...
261 просмотров
schedule
22.06.2022
Формат для импорта списка краев в igraph в python
Какой формат списка краев принимает igraph для импорта в python? Как должен выглядеть текстовый файл, содержащий мои взвешенные ребра?
Раньше я использовал igraph с R, но у меня нет работающей установки R на машине, которую мне нужно использовать,...
3724 просмотров
schedule
27.02.2023
Сопоставьте размер вершины с размером метки в igraph
Я пытаюсь построить небольшие сети, используя igraph в R. Каждая вершина в сети имеет имя, эквивалентное ее метке. Я хотел бы, чтобы каждая вершина имела прямоугольный символ, достаточно большой, чтобы соответствовать ее метке.
Это мое главное...
6101 просмотров
schedule
14.06.2023
igraph заполняет атрибуты узла после импорта списка краев в формате Ncol ()?
Я не уверен, что это слияние или два отдельных импорта, или что-то, что я должен полностью пересмотреть. Я начал использовать igraph после того, как поиграл в gephi, где я всегда выполнял двухэтапный импорт, сначала ребра, затем данные узлов. Это...
1553 просмотров
schedule
10.04.2023
выбор ребер на основе источника/цели в igraph
есть ли простой способ выбрать/удалить ребра на основе их источника и цели в igraph?
то, что я использую, по существу
g.es["source"] = [e.source for e in g.es]
g.es["target"] = [e.target for e in g.es]
g.es["tuple"] = [e.tuple for e in...
4924 просмотров
schedule
21.02.2023
переупорядочивание строк матрицы по последовательности данных внутри
В. У меня есть график erdos.reyni. Я заражаю вершину и хочу посмотреть, какой последовательности вершин последует заболевание? В igraph есть полезные функции, такие как get.adjacency(), Neighbours.
Это матрица смежности с именами вершин вместо...
81 просмотров
schedule
01.08.2023
Как получить список атрибутов ребра при выполнении Shortest.paths в igraph (R)
Мне нужно вычислить произведение атрибутов ребер кратчайшего пути между двумя вершинами в моем графе.
Например:
data<-as.data.frame(cbind(c(1,2,3,4,5,1),c(4,3,4,5,6,5),c(0.2,0.1,0.5,0.7,0.8,0.2)))
G<-graph.data.frame(data,...
1666 просмотров
schedule
08.07.2023
Как я могу создать точную цветовую шкалу в R для отображения цвета узла с помощью igraph?
Я использую igraph для построения небольшой сети (21 узел) на R. Я хотел бы, чтобы узлы были окрашены в соответствии с вектором postMean, который имеет значения:
[1] -0.035275268 0.016065216 -0.009860104 -0.110333756 0.027173563
[6]...
704 просмотров
schedule
01.08.2023
Как создать взвешенный список / матрицу смежности из списка краев?
Моя проблема очень проста: мне нужно создать список / матрицу смежности из списка ребер.
У меня есть список краев, хранящийся в документе csv, с column1 = node1 и column2 = node2, и я хотел бы преобразовать его в взвешенный список смежности или...
33438 просмотров
schedule
10.10.2023
С помощью igraph, как вызвать кривизну, когда стрелки указывают в противоположных направлениях
autocurve.edges отлично справляется с изгибом краев графических графиков, чтобы они не перекрывались, когда они указывают в одном направлении. Однако, когда они указывают в противоположных направлениях, кривизна не применяется.
d <-...
4328 просмотров
schedule
07.07.2023
Хак, позволяющий размеру стрелок в R igraph соответствовать ширине края
Хотя в руководстве говорится, что это будет в будущем:
arrow.size Размер стрелок. В настоящее время это константа, поэтому она одинакова для каждого ребра. Если передан вектор, то используется только первый элемент, т.е. если это берется из...
15593 просмотров
schedule
12.08.2023
