Вопросы по теме 'imagej'
Как я могу выполнять пакетную обработку изображений с помощью ImageJ в Java или clojure?
Я хочу использовать ImageJ для обработки нескольких тысяч изображений.
Есть ли способ взять любой общий плагин imageJ и автоматически применить его к сотням изображений?
Например, предположим, что я хочу взять тысячу изображений и применить к...
3161 просмотров
schedule
12.07.2023
Imagej: Как сохранить работу в редактируемом виде. С мерой ROI и изображением, связанным вместе?
В ImageJ мне нужно сохранить все измерения ROI (в диспетчере ROI), связанные с изображением. И есть возможность открыть в последнее время все еще редактируемый (переместить линию, переместить точку, сохранить измерение в результате). Так же есть...
1896 просмотров
schedule
08.02.2023
Обработка изображения: Вращательное выравнивание объекта
У меня есть стопка изображений с полосой рядом с центром. По мере продвижения стека полоса поворачивается вокруг одного конца, и весь стек содержит изображения с полосой, повернутой под разными углами до 45 градусов выше или ниже горизонтали.
Как...
4548 просмотров
schedule
06.11.2023
Увеличьте контрастность изображения с помощью библиотеки ImageJ (Java)
Я пытаюсь увеличить контрастность изображения в несколько раз x
Пока я могу читать изображение и получать такой процессор
ImagePlus im = new ImagePlus(imagePathHere);
ImageProcessor ip = im.getProcessor();
Я знаю о ContrastEnhancer.java...
1054 просмотров
schedule
04.02.2023
ImageJ, калибровка изображения в физическом масштабе с помощью калибровки?
Я хочу иметь возможность откалибровать изображение до физического расстояния, чтобы я мог обрезать изображение до физического расстояния, а не указывать номер пикселя для обрезки. Я видел класс Calibration в API ImageJ, и я могу установить...
1288 просмотров
schedule
03.01.2023
Нет открытых изображений - Макроязык Fiji / ImageJ
Я написал макрос на Фиджи для выполнения набора операций со всеми изображениями в определенной папке. Но я столкнулся с проблемой и не могу решить одну проблему. Когда я запускаю макрос, я получаю сообщение об ошибке «Нет открытых изображений». Что...
7039 просмотров
schedule
01.05.2022
В плагине Imagej, как сделать ROI доступным или активным в качестве выбора
Я написал java-плагин для ImageJ, который создает многоугольник, затем выполняет вызов setRoi(), затем вызов updateandDraw(), и все это для того, чтобы сделать полигон ROI доступным для многих команд меню ImageJ, таких как BLUR и т. д., для дальнейших...
1190 просмотров
schedule
03.04.2024
Сохранение в формате 16-битного .raww (формат необработанного изображения (Word)) в ImageJ или MATLAB для импорта в DaVis
У меня есть набор 32-битных файлов TIFF, которые образуют объемный набор данных (т. е. стек). Используя ImageJ, я уменьшаю их дискретизацию до 16-бит и экспортирую в виде необработанного файла. Предполагается, что затем они будут импортированы в...
942 просмотров
schedule
18.05.2023
Как объединить разные стеки в ImageJ?
Я пытаюсь найти способ объединить два стека вместе. Например, я делаю несколько изображений сомы нейрона в 60-кратном увеличении, а затем я возьму еще одну стопку в 60-кратном увеличении для базального дендрита. Тогда как я могу объединить их вместе?
42913 просмотров
schedule
09.03.2023
Java - Как написать очень большое (20 000 x 20 000 пикселей или больше) изображение tif
Я работаю с очень большими изображениями tif, которые я составляю в одно большое изображение. У меня есть библиотека, созданная моим коллегой, которая генерирует пирамиду изображений и предоставляет очень удобный инструмент для визуализации пирамиды...
2022 просмотров
schedule
08.06.2023
ImageJ/Fiji: итерация и печать в таблице результатов
У меня проблема с моим плагином Jython-Fiji:
IJ.run("Set Measurements...", "area centroid perimeter shape feret's area_fraction redirect=None decimal=6")
IJ.run("Analyze Particles...")
rt = ResultsTable.getResultsTable()
for roi in...
2014 просмотров
schedule
11.02.2023
Ввод и возврат аргумента командной строки Fiji/ImagJ?
Мне интересно, запускаю ли я Fiji в режиме --headless, как лучше всего передать параметры некоторым макросам? И как лучше всего вернуть какое-то сообщение (например, выполнение макроса выполнено или какое-то сообщение об ошибке)
Например, у меня...
1150 просмотров
schedule
03.06.2022
Вызов Java (плагин ImageJ BoneJ) из скрипта Jython
** Извините, я новичок как в python, так и в java, поэтому я могу не узнать, что на этот вопрос был дан ответ, и нужно только скорректировать его для моей ситуации.
По сути, у меня есть менеджер скриптов, который работает в среде Python, и мне...
308 просмотров
schedule
05.07.2022
ImageJ - инициировать событие при изменении кадра в ImageStack
Я пытаюсь создать плагин ImageJ, который генерирует стек масок на основе выбора в каждом кадре в активном стеке.
Для этого мне нужно очистить маску и сохранить ее при изменении кадра в стеке. Я не вижу никаких вариантов событий, доступных в API...
212 просмотров
schedule
03.07.2022
Автоматически распознаваемые объекты переносятся в области интереса в Imagej
Я столкнулся с проблемой в своей области, и мне нужны некоторые советы.
У меня есть изображение с кольцами деревьев.
Чтобы увидеть фотографию, с которой я хочу работать, вы можете проверить ее в моем Dropbox:...
1416 просмотров
schedule
18.03.2024
Библиотека ImageJ не может открыть изображения в формате tiff
Я написал ниже код, чтобы открыть одно изображение в формате TIFF. На самом деле я пытаюсь использовать библиотеку imageJ (ImagePlus) в одном из java-приложений. Но выдает сообщение об ошибке.
«ImageJ не может открывать файлы TIFF, сжатые таким...
4012 просмотров
schedule
19.09.2022
Сегментация изображения с использованием ImageJ
Я использую ImageJ и хочу реализовать свою собственную функцию для сегментации двухмерного бинарного изображения. Чтобы сделать это, мне нужно реализовать функцию увеличения области. Первый белый пиксель в моем изображении — это начальный индекс....
1288 просмотров
schedule
09.08.2023
Как работает exec(dir/w); функция работает в imageJ?
Как использовать exec() в imageJ, http://fiji.sc/ImageJ_tricks#Execute_external_programs ? Могу ли я использовать функцию exec() для запуска внешней программы Python с чем-то вроде:
exec("python", d:\py\program1.py");
Можно ли вернуть массив...
290 просмотров
schedule
29.05.2022
Масштабирование ImageJ не обновляет изображение
В приведенном ниже коде показано, что при открытии изображения пользователь должен иметь возможность увеличивать и уменьшать изображение с помощью клавиш со стрелками. Но когда я увеличиваю, я получаю следующую картину:
Я надеюсь, что кто-то...
272 просмотров
schedule
04.07.2023
Метод раунда ImageJ не работает должным образом?
Я тестировал это около часа, и я не понимаю, что происходит.
В imageJ, если я скажу:
i = 3.5;
print(round(i));
Я получаю 4 .
Однако, если я скажу:
print(65535/(27037-4777)*(26295-4777));...
372 просмотров
schedule
01.04.2023
