Вопросы по теме 'jags'
Как я могу преобразовать mcmc.list в объект ошибок?
Я использую библиотеку rjags R. Функция coda.samples создает mcmc.list , например (из example(coda.samples) ):
library(rjags)
data(LINE)
LINE$recompile()
LINE.out <- coda.samples(LINE, c("alpha","beta","sigma"), n.iter=1000)...
1547 просмотров
schedule
18.02.2023
странная ошибка jags.parallel/избегание ленивой оценки при вызове функции
У меня есть вызов функции (для jags.parallel ), который работает, когда задан числовой аргумент, такой как n.iter = 100 , но терпит неудачу, когда аргумент использует значение переменной, n.iter = n.iter . Похоже, это может быть ошибка в...
1751 просмотров
schedule
25.06.2022
Уловка нуля и единицы для байесовского обобщенного Пуассона с использованием JAGS
Я подгоняю данные подсчета к Обобщенному распределению Пуассона в JAGS, используя трюк нулей и единиц. Я следую кодам из книги «Байесовское моделирование с использованием WinBUGS» (стр. 286). Вот мои коды:
GPoisson.model <- function(){
C <-...
1976 просмотров
schedule
25.07.2023
Назначение предварительного распределения для нескольких параметров с помощью цикла for
Я прочитал руководство JAGS, но не нашел способа назначить одно и то же предварительное распределение нескольким параметрам в модели JAGS / R2JAGS.
Например, сейчас мне приходится повторять много такого кода:
reg.model <- function() {
#...
630 просмотров
schedule
19.08.2022
Ошибка при запуске PyMC — значение стохастика выходит за рамки его поддержки или запрещает текущие значения его родителей.
Я пытаюсь использовать PyMC, чтобы взять в качестве входных данных четыре различных предиктора состояния здоровья и объединить их, чтобы получить общую апостериорную вероятность того, что у пациента есть состояние, учитывая подмножество предикторов,...
1281 просмотров
schedule
24.03.2024
Доморощенный, Анаконда и другие девочки и мальчики
эры! Есть несколько сообщений, в которых обсуждается, как реагировать на:
brew doctor
т.е. с некоторыми предупреждениями. См., Например:
Файлы без пивоваренного пива
Доктор-пивовар - «предупреждение: заголовок не заварен. файлы...
1958 просмотров
schedule
03.10.2022
Ошибка выполнения JAGS: не удается вставить узел в X []. Несоответствие размеров
Я пытаюсь добавить немного кода в модель захвата-повторного захвата данных и придумываю некоторые ошибки, с которыми я раньше не сталкивался. Короче говоря, я хочу оценить серию фаз выживания, каждая из которых длится более одного временного...
712 просмотров
schedule
22.03.2024
предупреждение о неиспользуемых переменных в модели runjags
Я запускаю модели JAGS через пакет R. runjags . Я только что обновился до JAGS 4.0.0 с JAGS 3.4 и заметил неожиданное поведение, которое, похоже, связано с обновлением.
Во-первых, когда я запускаю модель, я получаю предупреждающее сообщение...
1399 просмотров
schedule
10.06.2023
Оценка JAGS AR (1) без исключения единичного корня
Я использую JAGS для выполнения байесовского анализа моделей ARMA. Мои данные - это смоделированные данные, поэтому я знаю результаты.
Пока что, если я оцениваю (например) стационарный процесс AR (1), я получаю хорошие результаты для параметра...
364 просмотров
schedule
15.09.2023
продление периода приработки после того, как модель JAGS была запущена в пробных версиях для R
Пакет runjags для R просто фантастический. Параллельные возможности и возможность использовать функцию extend.jags делают мою жизнь намного лучше. Однако иногда, после запуска модели, я понимаю, что фаза приработки должна была быть дольше. Как...
439 просмотров
schedule
20.06.2022
Оператор pow () в JAGS / BUGS
Это, наверное, неважно, но кое-что мне было интересно какое-то время.
При построении модели в JAGS / BUGS меня сначала учили обрабатывать преобразования мощности с помощью функции pow() (например, tau <- pow(sigma, -2) для преобразования из...
4303 просмотров
schedule
15.07.2022
Остатки и график конверта в R
Я подогнал регрессионную модель, используя JAGS, и теперь я хочу смоделировать конверт остатков, чтобы проверить соответствие этой модели. Предположим, что приведенная ниже матрица является матрицей остатков, где каждая строка представляет собой...
671 просмотров
schedule
14.12.2022
Невозможно оценить выражение подмножества в Jags
Я новичок в Jags, и я ломал голову, пытаясь понять, что я делаю неправильно с моим кодом, который выдает это сообщение об ошибке:
«Невозможно оценить выражение подмножества для precd».
Я прилагаю свой код, в котором также закодированы данные. Я...
1006 просмотров
schedule
28.02.2023
Подгонка многомерной модели дирлише в JAGS для R
Я пытаюсь подогнать многомерную модель к данным о составе видов, используя JAGS, реализованную в R. У меня есть данные об относительной численности 3 видов (ограниченных между [0,1]), два из которых коррелированы. Вот код для генерации подобных...
197 просмотров
schedule
11.04.2023
проблемы с подгонкой модели дирлише к смоделированным данным в JAGS, реализованным в R (бета-версия)
Допустим, у меня есть некоторые данные об относительной численности 3 видов. Вид 1 имеет отрицательную связь со среднегодовой температурой ( mat ). Данные об относительной численности хранятся в матрице r.spp.y :
#Simulate some species count...
90 просмотров
schedule
22.07.2023
Загадочная синтаксическая ошибка [] рядом с данными в зазубринах
При запуске моей модели зубцов я получаю следующее сообщение об ошибке
Ошибка синтаксического анализа файла модели: синтаксическая ошибка в строке 5 рядом с словом "данные"
Короче говоря, у меня есть две переменные ответа ( cmax и cmd )...
220 просмотров
schedule
24.08.2022
Как работать с несоответствующими параметрами с помощью функции inprod в модели JAGS
Я пытаюсь смоделировать вариацию в общем видовом богатстве с ковариатами среды обитания станции захвата камеры, используя R2jags . Однако я продолжаю получать ошибку:
"Error in jags.model(model.file, data = data, inits = init.values, n.chains =...
1216 просмотров
schedule
10.02.2023
Ошибка JAGS / BUGS - Возможный направленный цикл с участием некоторых или всех следующих узлов
Мой набор данных о штрафных ударах содержит 106 строк со следующими характеристиками:
Направление удара
Сильная нога игрока
HomeAway, которая сообщает нам, играет ли игрок в своем городе или за его пределами.
Я хотел бы выполнить...
98 просмотров
schedule
04.10.2022
Иерархическая модель с использованием JAGS для R показывает неправильное количество средних
У меня есть 2 столбца данных, y и grp , и я пытаюсь создать модель JAGS , показанную выше. grp - это группа, а у меня 5 групп. Следующий код взят из здесь . Я использую этот код, потому что описание под заголовком Model and Data...
77 просмотров
schedule
14.03.2023
Как вы кодируете дистрибутив Tweedie в JAGS/BUGS?
Я хотел бы запустить модель с распределенной переменной Tweedie, используя JAGS через R. Я знаю, что JAGS не имеет стандартного распределения Tweedie, но его можно указать как составную гамму/Пуассона. К сожалению, я не могу понять, как это...
109 просмотров
schedule
23.05.2023
