Этот проект был моей любимой курсовой работой в школьные годы, так как я познакомился с множеством различных методов, используемых в проекте Data Science. Кроме того, этот проект позволяет мне сотрудничать со студентом, специализирующимся на математике, где я изучаю математический подход при проведении исследовательского анализа. Набор данных был собран на факультете наук о жизни в моей школе. Поэтому я не буду делиться здесь полным набором данных, поскольку у меня нет на это..

Код для этого поста . Задний план Одна из моих статей касалась секвенирования опухолей мышиной модели тройного негативного рака молочной железы (ТНРМЖ) [1]. Мы секвенировали опухоли, используя данные секвенирования РНК. Если вы не знакомы с этой технологией, RNA-seq секвенирует транскрипты РНК, чтобы сообщить вам, какие части генома экспрессируются [2]. Наша модель мыши была генетически модифицирована для развития TNBC путем делеции гена Trp53 . Мы также удалили ген Brca1 у 50 %..

В сообщении на этой неделе я расскажу некоторую информацию, основанную на моем понимании будущего DeepLearning в эпоху одноклеточной омики. Это относится к проекту Human Cell Atlas, который недавно получил финансирование Seed Network от Научной инициативы Чана Цукерберга , и, как я вижу, это изменит курс понимания биологии человека. Начать с: Что такое инициатива "Атлас клеток человека"? Насколько мне известно, это одна из наиболее всеобъемлющих инициатив, которые были предприняты..

Автор Сохил Шах [ LinkedIn ] [ GitHub ] Соавторы: Николас Джангреко [ LinkedIn ] [ GitHub ], Хорди Франк [ LinkedIn ] [ GitHub ] и Мэтью Энг [ LinkedIn ] [ GitHub ] Это пост 3 из 4-х частей серии по геномике рака. Вы можете найти код из этого поста на Github . Если нет, ознакомьтесь с Постом 1 , в котором объясняется, как нужна геномная перспектива для поиска новых методов лечения рака печени, и Постом 2 , в котором подробно рассказывается о исследовательском анализе,..

«Мы уже знаем физические законы, которые управляют всем, с чем мы сталкиваемся в повседневной жизни… Это дань тому, как далеко мы продвинулись… что теперь нужны огромные машины и много денег, чтобы провести эксперимент, результаты которого мы не можем предсказать». - Стивен Хокинг R NA-seq - это революционная и мощная методика транскриптомики, которая облегчает изучение экспрессии генов за счет доступности и масштаба технологии секвенирования следующего поколения (NGS). В..