Вопросы по теме 'rscript'
Невозможно вызвать функцию roxygenize из пакетного файла Rscript
Я пишу скрипт, который использует roxygen2 для автоматической оксигенизации моего пакета. Я бы хотел, чтобы он был исполняемым, чтобы он мог быть частью более крупного сценария для подготовки и установки пакета, но по какой-то причине я не могу...
912 просмотров
schedule
07.07.2023
Сценарий R исчерпывает память — кластер Microsoft HPC
У меня есть сценарий R со следующим исходным кодом:
genofile<-read.table("D_G.txt", header=T, sep=',')
genofile<-genofile[genofile$"GC_SCORE">0.15,]
cat(unique(as.vector(genofile[,2])), file="GF_uniqueIDs.txt", sep='\n')
D_G.txt —...
543 просмотров
schedule
14.03.2023
JRI — проверка типа возвращаемого значения из R-скрипта
Я использую JRI и вызываю сценарий R из Java. Скрипт R возвращает целое число. Ниже показано, как я вызываю сценарий R:
REXP result = rengine.eval("source(\"" + [script name with path] + "\")");
REXP retVal = rengine.eval(getReturnVariable());...
559 просмотров
schedule
28.11.2022
Rscript: как $ интерпретируется в строках, передаваемых как встроенный код
Кто-нибудь знает, как $ интерпретируется во встроенном вызове rscript?
В приведенном ниже примере я пытаюсь сделать z элементом «a» в списке x. Однако z=x$a дает мне x вместо элемента списка.
> Rscript -e "x = list(a=c(1,2,3), b=c(4,5,6));...
158 просмотров
schedule
25.07.2022
Как написать bash-скрипт, который будет работать в Windows и Linux
Я пишу сценарий bash, который будет выполняться на компьютерах с Windows и Linux с терминала. Одна из строк вызывает Rscript, программу для выполнения программ .R. Проблема в том, что в Linux команда просто Rscipt , тогда как в Windows это...
1623 просмотров
schedule
13.03.2023
Могу ли я указать обязательные аргументы с помощью optparse
Я использую пакет optparse , но не могу понять, могу ли я укажите обязательные аргументы.
install.packages('optparse')
library('optparse')
library('data.table')
# example from vignette
option_list <- list(
# those 2 are linked together by...
2438 просмотров
schedule
23.01.2023
Запуск функции R над файлами в командной строке Bash
Я пытаюсь повторить функцию, которую я написал в R (strandcode.txt), по всем файлам в данном каталоге.
Strandcode.txt показан ниже, это простая функция для вычисления критерия хи-квадрат.
strand <- function(file){
data <-...
539 просмотров
schedule
09.05.2023
Эквивалент Mathematica's Which
Mathematica функция Which является обобщенной If :
Which[test_1, value_1, test_2, value_2, …]
оценивает каждый из test_i по очереди, возвращая значение value_i , соответствующее первому из них, которое дает True .
Это не более...
97 просмотров
schedule
17.09.2023
Ошибка в 1:nrow(newdata): аргумент длины 0 при использовании прогноза SVM
Я пытаюсь предсказать значения A на основе модели, обученной svm. Вот как выглядят мои обучающие и тестовые данные:
A B C D
r00 r01 r02 r03
... ... ... ...
Фрагмент кода приведен ниже:
featvecs = ["B"]
for (f...
9266 просмотров
schedule
19.01.2023
R Ошибка в validObject(.Object) при запуске как скрипт, но не в консоли
Следующий код отлично работает в консоли R (R 3.3.0):
m = system.file("external/pores_1.mtx", package = "Matrix")
x = Matrix::readMM(m)
Я могу поместить его в скрипт, и он отлично работает в консоли R, как:
source("test.R")
Однако,...
2664 просмотров
schedule
10.03.2023
Запуск кода R, содержащего пробелы, из командной строки Windows
Мне нужно запустить код R из командной строки, но путь, содержащий пробел, прерывает команду.
Этот код работает нормально:
Rscript -e "x=1;write.csv(x,'H:/this_folder/x.csv')"
Пока этот код:
Rscript -e "x=1;write.csv(x,'H:/that...
540 просмотров
schedule
19.08.2022
Запустите R-Script из Nodejs и Express
Это моя структура экспресс-сервера
--routes
----index.js
----graph.js
--scripts
----test.R
--server.js
Я пытаюсь вызвать скрипт R из файла graph.js, как показано ниже.
router.get('/test',function(req,res,next){
var R =...
2254 просмотров
schedule
26.07.2023
Можно ли остановить `Rscript`, очищающий его `tempdir`?
Я использую R через Rscript и H2O, но H2O дает сбой. Я хочу просмотреть журналы, но tempdir R, содержащий их, похоже, удаляется после завершения сеанса R (т. е. после завершения Rscript).
Можно ли указать R/Rscript не удалять используемую папку...
258 просмотров
schedule
30.11.2022
Rscript в Crontab не работает в Ubuntu Server 18.04
Ниже приведен мой очень простой Rscript под названием test.R , который я хочу запускать каждую минуту.
print("Hello, World!")
и я хотел бы автоматизировать этот сценарий в надежде, что смогу сделать то же самое для будущих сценариев....
959 просмотров
schedule
26.11.2022
Запуск скрипта в окнах планировщика заданий, где создается файл excel
Мне нужна помощь с этой проблемой. Поискав в Google, я нашел способ запустить R-скрипт без ошибок. Он создает файл .bat с каталогами Rscript.exe и скриптом, который я хочу запустить:
Мой сценарий очень прост: создайте фрейм данных и...
84 просмотров
schedule
06.06.2023
Запустите скрипт R и скройте фактический код от пользователя
Я создал скрипт кода R, который:
Читает некоторые данные из базы данных
Делает некоторые преобразования и..
экспортирует в csv измененную таблицу.
Этот код должен работать на клиентской машине, но нам нужно скрыть реальный код от...
201 просмотров
schedule
06.07.2022
