Публикации по теме 'survival'
CDSM - случайный вывод с использованием глубинных байесовских динамических моделей выживания
Мысли и теория
CDS - причинный вывод с глубокой моделью выживания и изменяющимися во времени ковариатами
Причинно-следственный вывод в данных длительного наблюдения за состоянием здоровья часто требует точной оценки воздействия лечения на время до наступления события в присутствии изменяющихся во времени ковариат. Чтобы решить эту проблему последовательной оценки эффекта лечения, мы разработали причинно-следственную динамическую модель выживаемости (CDS), которая использует структуру..
Переживет ли Python рецессию?
Python — это язык программирования, которому уже более 30 лет, и он по-прежнему набирает силу. Язык имеет множество библиотек для написания кода и обработки данных, но как насчет делового мира? Сможет ли Python пережить рецессию?
Python — не маленький язык.
Python — это высокоуровневый язык программирования общего назначения. Он был разработан Гвидо ван Россумом, который хотел создать лучшую среду для разработки программного обеспечения, чем то, что существовало в то время...
Вопросы по теме 'survival'
Сравнение p-значения Survdiff
Я пытаюсь провести анализ выживания на наборе данных, которые я собрал. В этом фрейме данных (m3) каждая строка — это новый пациент, а каждый столбец — мутация, которую я идентифицировал. Я составил двоичную таблицу данных, чтобы указать, является...
262 просмотров
schedule
03.10.2022
ggfortify не поддерживает сурфит нескольких ковеременных?
Следующий пример изменен из примера документа путем добавления «возраста».
d.coxph <- (survfit(Surv(time, status) ~ sex+age, data = lung))
autoplot(d.coxph)
Я получу следующую ошибку:
Ошибка в _2 _ (_ 3_, значение = if (nl == nL)...
397 просмотров
schedule
30.12.2023
Найдите значение R-квадрата подгонки Вейбулла (модель выживания) в R
У меня есть объект выживания (S), для которого я делаю подгонку Вейбулла, используя функцию survreg и распределение Вейбулла в R.
S = Surv(data$ValueX, data$ValueY)
W = Survreg(S ~ 1, data=data, dist="weibull")
Как извлечь значение...
672 просмотров
schedule
13.03.2023
Наложение различных объектов ggplot2
Раньше я пытался обратиться за помощью, но на самом деле не решил мою проблему. Дополнительную информацию можно найти здесь: (здесь вы можете найти набор данных)...
2686 просмотров
schedule
04.06.2022
Stata: Как очистить память от графиков sts?
У меня есть следующий код:
graph drop _all
sts graph if year==2014, saving(14)
sts graph if year==2015, saving(15)
sts graph if year==2016, saving(16)
gr combine 14.gph 15.gph 16.gph
Я хотел бы добавить строку, которая очистит предыдущий...
352 просмотров
schedule
17.02.2023
Выбор функций в mlr с использованием фильтра univariate.model.score для цензурированных данных
Я пытаюсь выполнить выбор функций в R с помощью mlr и фильтра univariate.model.score. В документации говорится, что Surv.rpart является обучающимся по умолчанию для этого фильтра. Мой набор данных содержит цензурированные данные о выживаемости, и я...
86 просмотров
schedule
11.08.2022
проведение теста Тьюки на R
Я пытаюсь провести тест Тьюки на данных (bmt), (KMsurv) и сосредотачиваюсь только на переменных t2 и d3. t2: время выживания без болезни (время до рецидива, смерти или окончания исследования) d3: индикаторная переменная для отсутствия болезни. d3 =...
44 просмотров
schedule
04.03.2023
Изменение набора продольных данных с помощью tmerge или SurvSplit?
Я пытаюсь провести анализ выживаемости с изменяющимися во времени ковариатами. Данные взяты из лонгитюдного опроса, который проводится ежегодно, и я изменил его так, чтобы он выглядел так:
id event end.time income1 income2...
132 просмотров
schedule
31.08.2022
Функция выживания с выпадающим меню для каждого гена
Я пытаюсь создать блестящее приложение, в котором вы можете выбрать разные miRNA во входных данных, а затем построить кривую выживаемости с помощью ggsurvplot . Что-то не так с функциями в fitSurv, но я не уверен, где я делаю это неправильно....
44 просмотров
schedule
03.05.2022
Кривая ROC в R с rpart для дерева выживания
У меня проблема с созданием кривой ROC для моего дерева выживания, созданного пакетом rpart. Моя цель состояла в том, чтобы оценить мое дерево выживания через площадь под кривой (AUC) на кривой ROC. Я пробовал много способов построить кривую ROC, но...
241 просмотров
schedule
24.11.2022
Запуск нескольких моделей Cox-PH с tidyr
У меня есть обычный Surv объект из пакета survival ;
s <- Surv(sample(100:150, 5), sample(c(T, F), 5, replace = T))
И матрица нескольких переменных;
df <- data.frame(var1 = rnorm(5),
var2 = rnorm(5),...
70 просмотров
schedule
12.04.2022
Как выполнить анализ выживаемости в R с изменяющимся во времени воздействием вмешательства, используя Surv и coxph?
У меня есть данные о выживании в этом формате с изменяющимся во времени воздействием Вторжения:
ID start stop status Intervention
1 2 14 0 0
2 2 5 0 0
3 2 3 0 0
3 3 10 1 1
4...
75 просмотров
schedule
25.06.2023
Как рассчитать доверительные интервалы для грубых коэффициентов выживаемости?
Предположим, что у нас есть объект survfit следующим образом.
fit = survfit(Surv(data$time_12m, data$status_12m) ~ data$group)
fit
Call: survfit(formula = Surv(data$time_12m, data$status_12m) ~ data$group)
n events median...
139 просмотров
schedule
11.11.2023
Ошибка в `levels‹-`(`*tmp*`, value = as.character(levels)) : уровень фактора [3] дублируется
Я пытаюсь построить многогранные кривые выживания с помощью автографика, но комбинация ковариат и их огранка дублируют уровни внутри факторов.
library(survival)
library(ggfortify)
fit <- survfit( Surv(time, status) ~ inst + sex,...
272 просмотров
schedule
10.10.2022