Публикации по теме bioinformatics

Публикации по теме 'bioinformatics'

Сколько грязи — это слишком много грязи — показатели качества в анализе экспрессии генов

автор: Аарон Догерти, доктор философии Менеджер, Discovery Software, twoXAR В twoXAR мы собираем множество разрозненных данных для быстрого определения методов лечения заболеваний. Благодаря этим различным данным мы получаем нашу предсказательную силу. Однако больше данных не всегда лучше, особенно если новые данные плохого качества. Другими словами, количество не важнее качества, и это из-за распространенной науки о данных: плохие данные на входе = плохие данные на выходе. Из-за..

SomaScan: мощный инструмент для протеомного анализа

Сила данных для понимания белков Исследование здоровья: как SomaScan раскрывает секреты белков Представьте себе SomaScan как сверхсовременный инструмент, который помогает ученым понять, как работает наше тело на крошечном уровне. Внутри нашего тела есть крошечные молекулы, называемые белками, которые выполняют важную работу, например, поддерживают наше здоровье и обеспечивают правильное функционирование нашего тела. SomaScan, созданный компанией SomaLogic, представляет собой..

VC: все о точечных диаграммах

Диаграммы рассеяния — один из самых популярных методов визуализации в мире. Его целью является распознавание кластеров и корреляций в «парах» переменных. Существует множество вариантов точечных диаграмм. Мы рассмотрим некоторые из них. Полосные диаграммы Диаграммы рассеяния, в которых один атрибут является категориальным, называются «полосовыми диаграммами». Поскольку трудно увидеть точки данных, когда мы наносим точки данных в виде одной линии, нам нужно немного раздвинуть..

ИИ помогает найти пропавшего человека с помощью уроков ДНК, которые окупятся

Нас окружает искусственный интеллект, или, точнее сказать, нас окружает атмосфера технологий. Нам невероятно повезло иметь его, поскольку он может обогатить нашу жизнь. Худшая боль, которую может испытать человек, — это потеря ребенка или близкого члена семьи. Но их можно вернуть нам с помощью искусственного интеллекта. ДНК, основной компонент клеток, состоит из генетического материала обоих родителей и вместе с ИИ задает направление для достижения цели. Ниже приведены некоторые..

Визуализация графиков сборки

Визуализация графов сборки для метагеномического анализа биннинга Некоторое время я работал с графами сборки метагеномов и наткнулся на много интересного. В этой статье я поделюсь с вами некоторыми из моих наблюдений, связанных с графами метагеномной сборки и контигами биннинга, полученными из этих графов. Предполагая, что у вас есть базовые представления о сборке генома (если нет, вы можете прочитать мою предыдущую статью Сборка генома - Святой Грааль анализа генома ), давайте..

Биоинформатика 1: Подсчет К-мер

Сложная, но интригующая междисциплинарная проблема Подсчет К-мер - интересная, но сложная задача биоинформатики. В этой статье мы поговорим о том, что такое k-мер, о проблеме подсчета k-мер, его приложениях и некоторых интересных выводах с точки зрения информатики. Кто такие k -меры? Проще говоря, k -меры - это подстроки длины k в заданной строке (может быть ДНК, РНК, белком или любой последовательностью строки). Поскольку нас интересует биоинформатика, мы сосредоточим наше..

Полное руководство по логистической регрессии с данными об экспрессии генов: обучение модели

Во второй части статьи я объясню, как обучать логистическую модель и как ее оценивать. Здесь вы найдете первую часть: Полное руководство по логистической регрессии с данными об экспрессии генов: математика Полное руководство по использованию логистической регрессии. Это первая часть, где я представляю концепцию… salvatore-raieli.medium.com Здесь вы найдете соответствующий блокнот Colab со всем кодом, показанным здесь и..