Публикации по теме bioinformatics

Публикации по теме 'bioinformatics'

Школа MedicAI

Я написал об этом в апреле 2017 года в собственном блоге, еще до того, как окончил медицинский институт и получил докторскую степень. Но я переместил все свои сообщения на Medium, поэтому я репостю их здесь. Это своего рода приквел к моей серии статей «Мое путешествие в программирование и биоинформатику». Я не обязательно согласен с этим на 100%; но я продолжаю в том же духе, потому что кому-то это может показаться интересным. В нашем образовании будущих врачей наблюдается заметная..

Классификатор случайных лесов для биоинформатики

В мире машинного обучения (ML), где исследователи и практики стремятся разработать новые методы и предложить еще один новый алгоритм для прогнозирования, классификатор случайных лесов (RFC) остается таким же важным, как и вчера. Современная биология использует ML и Data Science (DS) с беспрецедентной скоростью. В отличие от нейронных сетей, RFC непараметрический, интерпретируемый, эффективный и имеет высокую точность прогнозирования для нескольких типов данных. В результате RFC - один..

Машинное обучение в биоинформатике

Машинное обучение теперь просто повсеместно. Даже в Биоинформатике есть несколько задач, которые как будто специально придуманы для решения с помощью машинного обучения, и эта статья посвящена практическому применению методов машинного обучения на одном примере. Я хочу рассказать вам о небольшом проекте по прогнозированию связывающей активности лигандов с помощью ML. Весь код можно найти в Блокноте Jupyter . Так что не заморачивайтесь, скопируйте-вставьте это из статьи :)..

Что не так с десмоидной опухолью пациента X? (1/4)

Фон Пациентка X обнаружила шишку на спине, и после завершения биопсии ей поставили диагноз Десмоидная опухоль на спине. Опухоль была удалена хирургическим путем и до настоящего времени оставалась бездействующей. Однако в последнее время опухоль агрессивно вернулась. На сегодняшний день не было проведено окончательного генетического теста, подтверждающего генетический состав десмоидной опухоли, это означает, что мутации бета-катенина или APC не обнаружены , несмотря на то, что она..

Объезд: анализ графов [4]

Фон В предыдущем посте я рассказал о своем подходе к созданию графа на основе предложений для извлечения отношений. Канал Изменить описание medium.com В этом посте я собираюсь изменить некоторые этапы построения, чтобы посмотреть, смогу ли я получить лучший результат. Подход Я применил следующую схему для обновления весов узлов и ребер, чтобы исказить случайное блуждание. Я переключаю передачу, чтобы посмотреть,..

Понимание структуры объекта класса Phylo

Пакет R ape широко используется для любого анализа, связанного с филогенетикой и сравнительными методами, используемыми для изучения эволюции организмов. Первое, что требуется для проведения такого исследования, - это сохранить все признаки, которые определяют филогенетическое дерево. обезьяна делает это, создавая особую структуру под названием «Phylo». Что это за особенности? Что это за структура? Как они хранятся? Как они выглядят при визуализации? Давайте попробуем разобраться..

Машинное обучение в здравоохранении

Клиническая биоинформатика - это новая развивающаяся наука, сочетающая в себе клиническую информатику, биоинформатику, медицинскую информатику, информационные технологии, математику и омику. Потому что компьютер легко масштабировать по сравнению с докторами, и компьютеры могут работать круглосуточно, без выходных. Машинное обучение в биоинформатике Машинное обучение - это процесс, используемый для того, чтобы научить машину работать соответствующим образом. Сначала программа..